針對(duì)血液中攜帶的蛋白質(zhì)信息進(jìn)行挖掘能夠?yàn)榧膊≡缭\、疾病機(jī)制理解、治療靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)及個(gè)性化醫(yī)療等方面提供重要見解。十一長假剛剛結(jié)束，新一輪研究即將開展，磨刀不誤砍柴工，先來看看過去一個(gè)月各領(lǐng)域研究者們利用血漿蛋白組發(fā)表了哪些成果，獲取靈感強(qiáng)化自己吧。
9月13日，法國貝爾戈尼研究所團(tuán)隊(duì)通過空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)和血漿蛋白質(zhì)組學(xué)檢測(cè)發(fā)現(xiàn)瑞戈非尼與阿維魯單抗注射液聯(lián)合治療耐藥的胃癌患者，腫瘤微環(huán)境中M2型巨噬細(xì)胞顯著增多，S100A10蛋白在腫瘤細(xì)胞中顯著過表達(dá)。血漿蛋白組學(xué)檢測(cè)顯示血漿中CSF-1、IL-4、IL-8和TWEAK等細(xì)胞因子的升高與不良預(yù)后相關(guān)。巨噬細(xì)胞的免疫抑制作用以及S100A10的過表達(dá)是影響治療效果的關(guān)鍵因素。
該文章提示血漿蛋白質(zhì)組與免疫治療息息相關(guān)，能夠?yàn)榘┌Y的預(yù)后預(yù)測(cè)提供思路，指導(dǎo)癌癥個(gè)性化治療。
9月27日，華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院公共衛(wèi)生學(xué)院劉剛團(tuán)隊(duì)使用英國生物樣本庫中包含21892例參與者共2915種血漿蛋白的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)分析了與8種健康飲食模式（健康低脂飲食模式、地中海飲食模式、MIND飲食模式、AHEI-2010飲食模式、DASH飲食模式、hPDI飲食模式、rE-DII飲食模式和HLCD飲食模式）相關(guān)的蛋白，發(fā)現(xiàn)差異蛋白與糖尿病、心血管疾病、慢性呼吸疾病、慢性腎病和癌癥的風(fēng)險(xiǎn)降低及更長壽命有關(guān)，某些蛋白（如FSTL3和STC1）在飲食模式與疾病之間的關(guān)系中發(fā)揮中介作用。
該文章提示血漿蛋白質(zhì)組有助于深入理解飲食與慢性疾病之間的關(guān)系，具有個(gè)性化營養(yǎng)干預(yù)潛力。
9月7日，西安交通大學(xué)郭燕團(tuán)隊(duì)通過對(duì)680名創(chuàng)傷后有或沒有發(fā)生深靜脈血栓形成的患者進(jìn)行臨床指標(biāo)、血漿代謝組與蛋白質(zhì)組檢測(cè)，闡明了創(chuàng)傷后深靜脈血栓形成的代謝特征。基于臨床指標(biāo)與血漿代謝組檢測(cè)，該團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)了與創(chuàng)傷后深靜脈血栓形成相關(guān)的28種代謝物和2個(gè)臨床參數(shù)，并以580例樣本（252例創(chuàng)傷后深靜脈血栓形成患者血漿vs 328例對(duì)照）為發(fā)現(xiàn)集，100例樣本（50例創(chuàng)傷后深靜脈血栓形成患者血漿vs 50例對(duì)照）為驗(yàn)證集，通過機(jī)器學(xué)習(xí)進(jìn)行標(biāo)志物篩選，確定了可高效預(yù)測(cè)創(chuàng)傷后深靜脈血栓形成的9種代謝物標(biāo)志物組合?；谘獫{蛋白質(zhì)組檢測(cè)（96例創(chuàng)傷后深靜脈血栓形成患者血漿vs 87例對(duì)照），該團(tuán)隊(duì)從鑒定到的524種血漿蛋白中發(fā)現(xiàn)了與創(chuàng)傷后深靜脈血栓形成相關(guān)的214種蛋白質(zhì)，聯(lián)合代謝組數(shù)據(jù)分析，該團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)糖酵解/糖異生-TCA循環(huán)的上調(diào)可能通過增加紅細(xì)胞內(nèi)活性氧（ROS）水平促進(jìn)血栓形成，這表明這一代謝通路可能是創(chuàng)傷后深靜脈血栓形成潛在的治療靶點(diǎn)。
該研究提示血漿蛋白質(zhì)組能夠通過分析代謝通路蛋白，為代謝相關(guān)疾病提供更深刻的見解，并指示疾病潛在治療靶點(diǎn)。
9月4日，英國利茲大學(xué)利茲心血管及代謝醫(yī)學(xué)研究所團(tuán)隊(duì)使用英國生物樣本庫中包含53029例參與者共2923種血漿蛋白的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)與患者因感染而死亡的事件相關(guān)聯(lián)（240個(gè)事件，52520名參與者），通過泊松回歸模型評(píng)估，以發(fā)生率比（IRR）>1.5作為閾值，發(fā)現(xiàn)259種蛋白與感染死亡顯著相關(guān)，其中46種蛋白具有可用的遺傳評(píng)分。以INTERVAL隊(duì)列為發(fā)現(xiàn)集，以NSPHS和ORCADE隊(duì)列為驗(yàn)證集，使用蛋白質(zhì)數(shù)量性狀評(píng)分（pQTS）發(fā)現(xiàn)只有MER原癌基因酪氨酸激酶（MERTK）的pQTS與感染死亡顯著相關(guān)。使用沒有血漿蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)的363953例英國生物樣本庫參與者（984例感染死亡）數(shù)據(jù)對(duì)感染死亡率進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)研究（GWAS），兩樣本孟德爾隨機(jī)化分析表明血漿MERTK蛋白濃度增加與感染死亡率之間存在潛在因果關(guān)系。較高的MERTK濃度與較大年齡、男性及多種慢性疾病相關(guān)，MERTK與循環(huán)中的白細(xì)胞亞群和血小板計(jì)數(shù)也有關(guān)聯(lián)。
善用血漿蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)，結(jié)合基因組與孟德爾隨機(jī)化，純生物信息學(xué)內(nèi)容也能發(fā)14分一區(qū)SCI~
9月12日，中國科學(xué)院動(dòng)物研究所劉光慧團(tuán)隊(duì)與中國科學(xué)院北京基因組研究所張維綺團(tuán)隊(duì)及中國科學(xué)院動(dòng)物研究所曲靜團(tuán)隊(duì)合作，通過對(duì)健康的中老年雄性食蟹猴（相當(dāng)于人類的40-50歲）進(jìn)行40個(gè)月的二甲雙胍干預(yù)（2型糖尿病臨床治療劑量），對(duì)其生理功能、醫(yī)學(xué)影像、多種血液指標(biāo)、多個(gè)組織病理和多器官多組織多組學(xué)進(jìn)行分析，闡明長期服用二甲雙胍能夠顯著延緩食蟹猴的衰老，對(duì)全身11個(gè)系統(tǒng)79種組織器官發(fā)揮全面衰老保護(hù)效果。該團(tuán)隊(duì)基于血漿蛋白質(zhì)組學(xué)、血漿代謝組學(xué)、泛組織轉(zhuǎn)錄組學(xué)、DNA甲基化組學(xué)繪制了新的靈長類衰老時(shí)鐘，能夠用于準(zhǔn)確預(yù)測(cè)食蟹猴生物學(xué)年齡。該研究為抗衰藥物研究開辟了新的范式。
9月24日，美國明尼蘇達(dá)大學(xué)研究團(tuán)隊(duì)通過對(duì)11761例中年參與者和5183例老年參與者的血漿蛋白質(zhì)組檢測(cè)（共鑒定到4712種蛋白質(zhì)），使用其中2/3的樣本作為發(fā)現(xiàn)集，1/3的樣本作為驗(yàn)證集，通過彈性凈回歸構(gòu)建新的蛋白質(zhì)組學(xué)衰老時(shí)鐘ARIC PACs，并在驗(yàn)證集中利用Cox比例風(fēng)險(xiǎn)回歸分析了年齡加速和年齡加速變化與全因、心血管疾病、癌癥和下呼吸道疾病死亡率之間的關(guān)聯(lián)，發(fā)現(xiàn)ARIC PACs和已發(fā)表的3個(gè)衰老時(shí)鐘與死亡風(fēng)險(xiǎn)增加有相似的相關(guān)性。
上述兩篇文章提示衰老時(shí)鐘有望成為生物學(xué)年齡的生物標(biāo)志物，可作為預(yù)測(cè)病死率、評(píng)估抗衰老生活方式和治療干預(yù)效果的工具。
通過對(duì)以上前沿文章的學(xué)習(xí)，想必大家對(duì)血漿蛋白質(zhì)組的研究思路和研究方法有了更深刻的認(rèn)知。青蓮百奧針對(duì)血漿蛋白質(zhì)組研究需求，獨(dú)家推出疾病標(biāo)志物篩選、預(yù)后標(biāo)志物篩選、分子分型、PWAS高級(jí)分析報(bào)告，助大家在科研的海洋中乘風(fēng)破浪。
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