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質(zhì)譜、SomaScan、Olink三強爭霸!基于功能蛋白分析的血液蛋白質(zhì)組學檢測方法選擇指南

在過去的一年中,血液蛋白質(zhì)組學領(lǐng)域質(zhì)譜法(MS)、SomaScan和Olink三大技術(shù)的成熟推動疾病研究進入“一滴血時代”,但耀眼數(shù)據(jù)背后,研究者正陷入前所未有的技術(shù)選擇焦慮:三大主流技術(shù)平臺成本差異懸殊,功能蛋白覆蓋有什么差異?靶向與非靶向的技術(shù)路線,疾病研究應該選擇誰?

青蓮百奧基于十余年技術(shù)積累,首次將最新人血漿蛋白質(zhì)譜法(MS)自建庫(QLHPP)與SomaScan、Olink靶向平臺進行多維硬核對比,在功能蛋白檢出、疾病領(lǐng)域覆蓋等關(guān)鍵指標上揭示顛覆性結(jié)論,助您破解血液組學研究"選擇困難癥"。


技術(shù)介紹

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深度比較

青蓮百奧最新人血漿蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(QLHPP)基于獨家專利MagicOmics-DMB磁珠試劑盒進行低豐度蛋白富集前處理,基于質(zhì)譜法(MS)使用timsTOF HT DIA 22 min檢測構(gòu)建,共收錄11012個蛋白質(zhì),覆蓋>90%人類蛋白質(zhì)圖譜(HPA)數(shù)據(jù)庫收錄的人血漿蛋白。

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QLHPP與HPA數(shù)據(jù)庫收錄人血漿蛋白venn圖

HPA數(shù)據(jù)庫收錄的血漿蛋白均為擁有至少2個≥9個氨基酸的非嵌套唯一映射肽的典型蛋白,擁有良好的可驗證性。比較QLHPP、SomaScan、Olink蛋白與HPA數(shù)據(jù)庫收錄蛋白,發(fā)現(xiàn)QLHPP能夠?qū)PA數(shù)據(jù)庫實現(xiàn)最全面的覆蓋(QLHPP 92%,Somascan 76%,Olink 46%),且擁有最豐富的獨特鑒定蛋白(QLHPP 2923,Somascan 1984,Olink 715),代表其對驗證與發(fā)現(xiàn)研究的全面兼容。

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QLHPP、Somascan、Olink與HPA數(shù)據(jù)庫收錄人血漿蛋白venn圖

基于HPA數(shù)據(jù)庫血漿蛋白豐度信息,比較QLHPP、SomaScan、Olink對不同豐度的蛋白質(zhì)的覆蓋度,發(fā)現(xiàn)QLHPP能夠最全面地覆蓋血液低、中、高豐度蛋白質(zhì),代表質(zhì)譜法可對血液蛋白實現(xiàn)無偏深度檢測。

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QLHPP、Somascan、Olink對HPA數(shù)據(jù)庫各豐度人血漿蛋白的覆蓋率

近期,在2024年實現(xiàn)7000+血漿蛋白質(zhì)組鑒定數(shù)突破的基礎(chǔ)上,2025年青蓮百奧血液蛋白質(zhì)組高深度“峨眉”方案(MagicOmics DMB低豐度蛋白富集+timsTOF HT/Orbitrap Astral DIA質(zhì)譜檢測)人血漿樣本項目可穩(wěn)定鑒定5500~7500個蛋白質(zhì),為血液蛋白深度挖掘提供了良好的土壤。

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功能比較

COG(Clusters of Orthologous Groups)分析基于COG數(shù)據(jù)庫提供蛋白質(zhì)的功能分類注釋。比較QLHPP、SomaScan、Olink蛋白的COG注釋,發(fā)現(xiàn)QLHPP能夠最全面地覆蓋多數(shù)蛋白質(zhì)功能類型。在疾病研究中,對不同信號或代謝通路的功能蛋白開展研究,能夠反應更具生物學意義的疾病變化,為標志物、機制、藥靶研究提供更有力的支持。

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此外,通過Uniprot數(shù)據(jù)庫對血漿中鑒定到的蛋白質(zhì)相關(guān)的生物學途徑、疾病、分子功能等信息進行注釋,發(fā)現(xiàn)QLHPP也能夠最全面地覆蓋多數(shù)常見通路、疾病與功能。

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血液蛋白與多種疾病發(fā)生發(fā)展相關(guān),囊括諸多藥物靶點蛋白。通過DrugBank、FDA、KEGG Drug、ChEMBL、Phenotypes數(shù)據(jù)庫的注釋信息,可以更好地了解血液蛋白與疾病的關(guān)系。比較QLHPP、SomaScan、Olink蛋白的疾病藥靶數(shù)據(jù)庫注釋,發(fā)現(xiàn)QLHPP能夠最全面地覆蓋多個疾病藥靶數(shù)據(jù)庫。

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來源比較

血液不具備蛋白質(zhì)合成功能,血液中的蛋白質(zhì)由身體各組織器官分泌釋放而來,因此組織器官溯源對血液蛋白質(zhì)組研究具有重要意義,能夠支持對不同部位起源疾病及并發(fā)癥的精準解析。使用HPA數(shù)據(jù)庫的人類正常組織器官數(shù)據(jù)對血液蛋白的組織器官來源進行注釋,比較QLHPP、SomaScan、Olink蛋白,發(fā)現(xiàn)QLHPP能夠最全面地覆蓋多個組織器官來源。

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蛋白質(zhì)亞細胞定位預測在生物學研究中具有重要意義。比較QLHPP、SomaScan、Olink蛋白,發(fā)現(xiàn)QLHPP能夠最全面地覆蓋細胞核、細胞質(zhì)來源蛋白,表明質(zhì)譜法能夠深入覆蓋來源于細胞內(nèi)、細胞核的低豐度蛋白,探索信號通路變化,助力進一步的疾病機制與藥物靶點研究。

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應用展望

隨著檢測技術(shù)的成熟,針對血漿蛋白的研究日漸深入,豐富的血漿蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)可以獲得有關(guān)疾病、衰老過程以及疾病風險預測的新見解。

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血漿蛋白質(zhì)組檢出量逐年提升

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血漿蛋白質(zhì)組深度提升助力更多領(lǐng)域研究

 

深度保障

針對血漿蛋白質(zhì)組低豐度蛋白檢測難點,青蓮百奧提供獨家專利產(chǎn)品低豐度蛋白富集磁珠試劑盒(MagicOmics DMB),結(jié)合自動化樣本前處理機器人(MagicOmics-AP-96-Pro)與timsTOF HT/Orbitrap Astral先進質(zhì)譜平臺,可實現(xiàn)高通量血漿蛋白質(zhì)組樣本標準化制備與高深度檢測,輕松承接大隊列血漿標志物研究項目。

對于100例以上人血漿樣本,按照推薦流程標準化采集、質(zhì)檢合格并執(zhí)行高深度峨眉方案(MagicOmics DMB低豐度蛋白富集+timsTOF HT/Orbitrap Astral DIA質(zhì)譜檢測),青蓮百奧承諾蛋白鑒定數(shù)5000+!

步驟雖繁必不敢省人工,試劑雖貴必不敢減物力,青蓮百奧助您在科研的海洋中乘風破浪~

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